ユーザによるOrganizationの作成の禁止

You can prevent users from creating organizations in your enterprise.

In the top-right corner of GitHub Enterprise Server, click your profile photo, then click Enterprise settings.

Enterpriseアカウントのサイドバーで、 Policies（ポリシー）をクリックしてください。
Under Policies, click Options.
[Users can create organizations（ユーザによるOrganizationの作成可能）] の下で、ドロップダウンメニューを使って [Enabled（有効化）] あるいは [Disabled（無効化）] を選択してください。