GitHub elimina automáticamente las claves SSH inactivas para mantener la seguridad de las cuentas, por ejemplo, cuando alguien deja el trabajo o pierde su computadora.
Puedes verificar si has usado o no una clave SSH durante un año revisando el registro de seguridad de tu cuenta. Para más información, consulta Revisar tu registro de seguridad.
Una vez que tu clave SSh se ha eliminado, debes generar una nueva clave SSH y asociarla con tu cuenta. Para más información, consulta Generación de una nueva clave SSH y adición al agente SSH y Agregar una clave SSH nueva a tu cuenta de GitHub.