Qualquer pessoa com permissões de administrador em um repositório pode habilitar ou desabilitar a exclusão automática de branches.
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No sua instância do GitHub Enterprise Server, navegue até a página principal do repositório. 1. Abaixo do nome do repositório, clique em Configurações. Caso não consiga ver a guia suspensa "Configurações", selecione o menu suspenso e clique em Configurações.
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Em "Solicitações de pull", marque ou desmarque Excluir branches principais automaticamente.