Se o repositório do seu site do GitHub Pages contiver submódulos, o conteúdo dele será inserido automaticamente quando o site for criado.
Só é possível usar submódulos que apontem para repositórios públicos, porque o servidor do GitHub Pages não pode acessar repositórios privados.
Use a URL somente leitura para os submódulos, inclusive os aninhados. É possível fazer essa alteração no arquivo .
Leitura adicional
- Ferramentas do Git – Submódulos do livro Pro Git
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