Remover um colaborador externo do repositório da organização
Os proprietários e administradores do repositório podem remover o acesso de um colaborador externo a um repositório.
Apesar de as bifurcações de repositórios privados serem excluídas quando um colaborador é removido, o colaborador mantém todos os clones locais do seu repositório.
Remover colaboradores externos de todos os repositórios da organização
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In the top right corner of GitHub Enterprise, click your profile photo, then click Your profile.
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On the left side of your profile page, under "Organizations", click the icon for your organization.
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Under your organization name, click People.
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Under the "People" tab, click Outside collaborators.
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Selecione um ou mais colaboradores externos que deseja remover da organização.
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Use o menu suspenso acima da lista de colaboradores externos e clique em Remove from all repositories (Remover de todos os repositórios).
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Revise os colaboradores externos que serão removidos da organização e clique em Remove outside collaborators (Remover colaboradores externos). 
Remover um colaborador externo de um repositório específico na organização
Se você desejar remover um colaborador externo de repositórios específicos na organização, poderá remover o acesso desse usuário a um determinado repositório por vez.
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In the top right corner of GitHub Enterprise, click your profile photo, then click Your profile.
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On the left side of your profile page, under "Organizations", click the icon for your organization.
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Under your organization name, click People.
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Under the "People" tab, click Outside collaborators.
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À direita do nome de usuário do colaborador que deseja remover, use o menu suspenso e clique em Manage (Gerenciar).
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À direita do repositório do qual deseja remover o colaborador externo, clique em Manage access (Gerenciar acesso).
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Para remover completamente o acesso do colaborador externo ao repositório, clique em Remove access to this repository (Remover acesso a este repositório) no canto superior direito.
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Para confirmar, clique em Remove access (Remover acesso).