ユーザによるOrganizationのリポジトリ削除の禁止
メンバーが GitHub Enterprise Server アプライアンス上で Organization 内のリポジトリを削除したり移譲したりするのを禁止できます。
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任意のページの右上の隅で をクリックしてください。
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左サイドバーで [Admin center] をクリックします。
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[Users can delete repositories(ユーザはリポジトリを削除可能)] の下でドロップダウンメニューを使い、[Disabled(無効化)] を選択してリポジトリの削除と移譲ができるのをサイト管理者だけに制限してください。