Não é possível instalar GitHub Apps de terceiros em organizações pertencentes à sua instância.
Para obter mais informações sobre como instalar GitHub Apps de sua propriedade, confira "Instalando seu próprio Aplicativo GitHub".
Instalando um Aplicativo GitHub de terceiros
Você pode instalar GitHub Apps diretamente do proprietário do aplicativo para usar em seu conta pessoal ou em suas organizações.