Para baixar um arquivo do seu repositório, você pode usar a API para usuário ou migrações da organização. Para obter mais informações, consulte "Migrações".
Depois de ter após baixar o seu arquivo, você pode copiá-lo para um disco rígido externo e/ou enviá-lo para um serviço de backup baseado em nuvem como o Google Drive ou Dropbox.
Ferramentas de backup de terceiros
Existem várias ferramentas de autoatendimento que automatizam backups de repositórios. Ao contrário de projetos arquivados, que arquivam todos os repositórios públicos em GitHub que não tenham optado por não participar e tornam os dados acessíveis para todos, as ferramentas de backup irão fazer o download dos dados de repositórios específicos e organizá-los em um novo branch ou diretório. Para obter mais informações sobre projetos de arquivamento, consulte "Sobre arquivamento de conteúdo e dados no GitHub". Você pode fazer backup de todos os dados de um repositório Git (como arquivos de projeto e histórico de commit), bem como da quantidade de dados de
GitHub (como problemas e pull requests), com BackHub, que cria backups recorrentes diários dos seus repositórios com instantâneos de até 30 dias no tempo. O BackHub está disponível no GitHub Marketplace.